La Cartoteca del Laboratorio di cartografia e GIS si occupa di acquisizione, archiviazione, trattamento, diffusione e distribuzione informatizzata del patrimonio cartografico, fotografico, aerofotografico e di rilievo, in cooperazione con gli enti culturali e i produttori ufficiali di documentazione per lo scambio di materiale e l’elaborazione di prodotti di comune interesse e conserva oltre 100.000 documenti a stampa e in digitale, riferiti soprattutto al territorio nazionale, di diverse epoche e a differenti scale di rappresentazione
Nel catalogo sono descritte carte: geografiche (dell'Europa e dell'Africa), corografiche (riguardanti l'Italia, ma anche stati dell'Europa e dell'Africa), topografiche (soprattutto dell’Istituto Geografico Militare), tecniche e urbane (prodotte da enti territoriali), tematiche, fotografiche e storiche (principalmente riproduzioni di originali conservati presso Archivi di Stato, musei e biblioteche inerenti vedute prospettiche, piante urbane e topografiche, mappe territoriali e catasti storici).
